Hallo,
das Problem sind manche Zertifikate, die von LiveConfig angelegt werden.
Mal in den Ordner "/etc/ssl/certs" wechseln und dort "ls -la | grep 'ca.crt' | grep '\->'" ausführen. Es sollten dann Verlinkungen sichtbar werden, die man löschen muss. Danach funktioniert das mit Let's Encrypt Zertifikaten wieder.
Problem ist die Updateroutine von ca-certificates. Hier werden Hashwerte erstellt und zu den Zertifitkaten verlinkt. Wenn dabei ein Zwischenzertifikat von LE enthalten ist, dann wird die Validierung mit diesem vorgenommen und nicht gegen ca-certificates.crt. So weit für mich ersichtlich, handelt es sich dabei um ältere Dateien, da die Zeitstempel teilweise aus 2020 sind. Aber genaue Ursache suche ich noch selbst.