Oha. Das klingt danach als ob auf dem Server noch mehr Rechte "zerschossen" sind.
Für CSS/JS sind diese Dateien relevant:
/usr/share/liveconfig: root:root/mode=0755
/usr/share/liveconfig/*: root:liveconfig, mode=0750
/usr/share/liveconfig/html: root:root, mode=0755
/usr/share/liveconfig/html/*: root:root, mode=0644
Es gibt aber auch noch Dateien in /usr/lib/liveconfig und an vielen anderen Orten.
Im Zweifelsfall installieren Sie am besten das LiveConfig-Paket noch mal neu (apt-get install --reinstall ...)
Machen Sie aber vorher ein Backup der LiveConfig-Datenbank (/var/lib/liveconfig/liveconfig.db) und kopieren diese ggf. nach dem Reinstall zurück.